Le SSM est une plate-forme de recherche dépendant du
Département Systématique & Evolution,
spécialisée en phylogénie
moléculaire et en génétique des
populations. Ses crédits de fonctionnement et
d'équipement proviennent de I'IFR 101 (Dir R. Barbault), le
PPF fournissant les contrats d'entretien.
Broyeurs:
Mill MM300 à
billes.
Mill 6850 Freezer;
cryobroyeur. dans le Box ADN ancien.
Extracteur ADN/ARN
( en plaque 96 puits) ABI PRISM 6100 Nucleic Acid
Prep Station - Applied Biosystems.
Appareil PCR (10 en tout dont celui à gradient
ci-dessous) :
Eppendorf : 1 x EP Gradient - plaque 96 puits et gradient de
température.
Système UV E
Box :
Biodoc-it: système imagerie gels.
Séquenceur
automatique mono-capillaire ABI PRISM 310 - Applied
Biosystems.
Station de
caryotypage/FISH-Imaging
Descriptif et présentation du matériel
Il s’agit d’un
microscope
Zeiss Axioplan à lumière transmise,
Objectifs (X10, X20, X100 NEOFLUAR).
Equipement épifluorescence : Lampe à mercure
100W, roue de filtres, caméra refroidie Coolsnap
(Photometrics),
Logiciel « Genus » de caryotypage et FISH Imaging.
Le logiciel est adapté au tri et classement manuel ou
automatique de chromosomes animaux marqués en bandes ou non
et à l’établissement de caryotypes
standards par espèce. Une fonction idiogrammes est
utilisable. Le logiciel permet également la saisie rapide et
le traitement d’images en fluorescence et est
particulièrement adapté à la FISH sur
chromosomes (hybridation in situ en fluorescence). Des informations
détaillées sur les fonctions du logiciel sont
accessibles sur le site web
http://www.aicorp.com/products/01genus.
Le système est sous contrat d’entretien annuel qui
inclut les mises à jour régulières du
logiciel et la réparation et/ou remplacement des
pièces défectueuses (caméra, roue de
filtres) dans un délai de trois jours.
Cette plate-forme est ouverte sur programme à tous (MNHN et
équipes de l'IFR 101), après validation par une
commission technique.
Le coût de fonctionnement comprend une inscription
forfaitaire de 100€ par mois ainsi que les frais
réels des différentes grandes
catégories de consommables (Clônage, Kit
d'extraction, Amorces, Taq).
En ce qui concerne la Station
de
caryotypage/FISH-Imaging :
En dehors des programmes
de recherche de l’équipe nécessitant
l’utilisation du système, nous accueillons en
priorité les chercheurs et étudiants du MNHN et
de l’UMR 7138, ainsi que des visiteurs européens
(Programme SYNTHESIS).
Nous pouvons offrir (avec participation financière de
l’équipe demandeuse dans une limite raisonnable,
à discuter) notre aide pour la technologie de la FISH sur
chromosomes avec différents types de sondes (uniques ou
répétées, clonées ou non)
et/ou l’accès au système et la
formation à son utilisation.
Pour un premier essai de faisabilité, nous ne demandons pas
de contribution financière.
Nos possibilités sont cependant limitées par la
disponibilité d’un seul poste.
UMR 7138, Systématique, Adaptation Evolution
Département Systématique et Evolution
43, rue Cuvier
75005 PARIS (France)
3ème étage
Dr Pasquet, Eric (pasquet@mnhn.fr)
Téléphone : (33) 1 40 79 38 22
Fax : (33) 1 40 79 38 44
Station
de
caryotypage/FISH-Imaging :
Catherine Ozouf-Costaz (I.R. CNRS) : 01 40 79 37 54
Jean-Pierre Coutanceau (I.R. CNRS) : 01 40 79 38 39
Pour en savoir plus : http://www.mnhn.fr/mnhn/ssm/index.html